La fundación realiza la investigación para la conservación marina y terrestre, por lo que define así su labor:
• Asesoramiento científico al Servicio Parque Nacional Galápagos.
• Educación ambiental, promoviendo el apoyo y la participación de la comunidad local en la conservación de Galápagos.
• Asesoramiento técnico en la formulación de leyes, regulaciones, políticas y planes para la conservación
• Formación de estudiantes ecuatorianos y extranjeros involucrados en la conservación, por medio de becas y voluntariados.
• Apoyo operativo a científicos visitantes, que vienen de todo el mundo para investigar en este “laboratorio viviente de la evolución”

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